In un suggestivo itinerario, che percorre tutto l'abitato, si possono ammirare i tanti monumenti cristiani eretti nel corso dei secoli. A partire dal borgo antico è possibile visitare: nel Castello, la Chiesa di Sant'Agata; lungo il crinale nord-ovest del paese, la Chiesa di Sant'Andrea e la Chiesa di San Michele Arcangelo, dirigendosi verso la Porta Nuova si giunge alla Chiesa della SS.Trinità, continuando a percorrere l'asse vario che conduce sul crinale opposto del monte, si raggiunge la Chiesa Madre di San Nicola e la Chiesa della Madonna del Carmine. Fuori le mura vi sono: la Chiesa di San Rocco, la Chiesa della SS.Annunziata con il Convento dei Frati Francescani Minori Conventuali, la Chiesa di Santa Maria delle Grazie, la Cappella del calvario, la Chiesa Madonna dell'Arco, la Chiesa del Cimitero. La maggior parte di dette Chiese sono state edificate agli estremi lati del paese, cosi da poter ottenere più spazio in profondità e poterle realizzare in modo ampio e nelle architetture e disegni desiderati. Il patrimonio artistico conservato nelle Chiese di Sant'Agata di Puglia è considerato di notevole importanza.Tra le opere interessanti, si segnalano:

Chiesa Sant'Agata: dipinti su tele raffiguranti Sant'Agata, Santa Lucia, la Madonna con gli Angeli.

Chiesa Sant'Andrea: Crocifisso ligneo del XVII sec. - Coro in legno di noce del XV sec.-Affreschi navata centrale.

Chiesa San Michele Arcangelo: Trittico del Santi, opera pittorica su tavola di legno, XV sec. , scuola senese.

Chiesa San Nicola: Pala di San Gaetano, opera pittorica del Pacecco de Rosa, anno1654-Trittico della Parrocchia, opera scultorea in legno ed oro del XVII sec. - Coro ligneo del XVII sec. - Presepe, opera scultorea in pietra, XVI sec. - La Passione, opera pittorica ad encausto, realizzata nel XX secolo dall'artista Enzo Liberti.